Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NapbP28663 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NapbP28663 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms