Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Celf1P28659 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Celf1P28659 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Celf1P28659 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms