Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hoxd10P28359 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd10P28359 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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