Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa2P28309 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa2P28309 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms