Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Lef1P27782 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms