Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms