Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NelfeP19426 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NelfeP19426 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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