Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrgnP13609 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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