Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RaraP11416 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RaraP11416 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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