Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxd3P09027 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxd3P09027 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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