Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Spta1P08032 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms