Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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