Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms