Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
DffaO54786 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
DffaO54786 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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