Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms