Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Bnc1O35914 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bnc1O35914 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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