Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timm44O35857 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timm44O35857 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms