Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Opn1mwO35599 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms