Protein–RNA interactions for Protein: O35486

Crygs, Beta-crystallin S, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygsO35486 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrygsO35486 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CrygsO35486 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CrygsO35486 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms