Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Polr1aO35134 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms