Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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