Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms