Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sec22bO08547 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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