Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
MsmbO08540 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
MsmbO08540 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms