Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms