Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm379J3QQ19 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm379J3QQ19 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms