Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms