Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm5849J3QPE5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm5849J3QPE5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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