Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms