Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf148G3X9R7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rnf148G3X9R7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rnf148G3X9R7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf148G3X9R7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms