Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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