Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pagr1bF6V0H0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms