Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21977F6U3N7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms