Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap58B2RW38 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap58B2RW38 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms