Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Apol7aB2RT54 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apol7aB2RT54 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms