Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Uhrf1bp1B2KF50 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms