Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Grik3B1AS29 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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