Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf2A3KGV1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms