Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm6880A3KG45 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm6880A3KG45 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm6880A3KG45 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm6880A3KG45 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm6880A3KG45 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm6880A3KG45 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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