Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2al1jA2BFR3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms