Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttll9A2APC3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttll9A2APC3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms