Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms