Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pramef6A2A8M8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms