Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms