Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Uso1Q9Z1Z0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms