Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms