Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms