Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1a4Q9WV27 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms