Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnip1Q9WUU8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms