Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM5BQ9UGL1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM5BQ9UGL1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms